Na Międzyuczelnianym Wydziale Biotechnologii prace badawcze są prowadzone w następujących zespołach naukowo-badawczych:

• Laboratorium Badawczo-Wdrożeniowe
• Pracownia Immunologii Doświadczalnej i Translacyjnej
• Pracownia Struktury Biopolimerów
• Pracownia Symulacji Układów Biomolekularnych
• Pracownia Biofizyki
• Pracownia Biochemii Fizycznej
• Zakład Badania Związków Biologicznie Czynnych
• Zakład Biochemii Białek
• Zakład Biochemii Ewolucyjnej
• Zakład Biochemii Roślin
• Zakład Mikrobiologii Roślin
• Zakład Biologii Molekularnej
• Zakład Bakteriologii Molekularnej
• Zakład Biologii Komórk i Immunologiii
• Zakład Biologii Molekularnej Wirusów
• Zakład Biologii Strukturalnej
• Zakład Fotobiologii i Diagnostyki Molekularnej
• Zakład Enzymologii i Onkologii Molekularnej
• Zakład Ochrony i Biotechnologii Roślin
• Zakład Onkologii Translacyjnej
• Zakład Szczepionek Rekombinowanych
• Zespół Laboratoriów Specjalistycznych